啤酒酵母水解受水解温度、PH、反应时间等因素的影响，而木瓜蛋白酶是一种在酸性、中性、碱性环境下均能分解蛋白质的蛋白酶，而且耐热性强，在90℃时也不会完全失活。啤酒酵母水解过程中，啤酒酵母还在正常的代谢。双乙酰是啤酒酵母的正常代谢产物，双乙酰过量会导致啤酒酵母液产生“馊饭味”，导致啤酒酵母液风味改变。经研究表明，木瓜蛋白酶能有效的促进双乙酰的分解，从而保持啤酒酵母液双乙酰的平衡，保持其风味不变。