牡蛎多肽以及牡蛎低聚肽生产加工酶解是至关重要的一个环节，选对酶制剂是很重要的。客户采用的酶均为单酶酶解为主。单酶（中性蛋白酶、碱性蛋白酶等）属内切酶，由于水解的切位点不同，酶解出来的牡蛎肽差异巨大。主要表现为牡蛎肽氨基酸、牛磺酸、锌、硒等可溶性营养成分、味道及小肽含量有明显的差异。为了弥补了几种酶的不足，必须采用通过多种单体酶系组合生产的复配蛋白酶--海产品水解专用复合酶制剂进行加工提取，才能达到良好的效果，从而生产出生物活性更高的牡蛎肽。